这些试点县市，要将80%的农资综合补贴存量资金，加上种粮农民直接补贴和农作物良种补贴资金合并，政策目标则调整为“耕地地力保护”。。对已作为畜牧养殖场使用的耕地、林地、成片粮田转为设施农业用地、非农业征(占)用耕地等已改变用途的耕地，以及长年抛荒地、占补平衡中“补”的面积和质量达不到耕种条件的耕地等不再给予补贴。用于耕地地力保护的补贴资金直接现金补贴到户。
根据《意见》，其支持的粮食适度规模经营，既可以是以土地有序流转形成的土地适度规模经营，也可以是土地股份合作和联合或土地托管方式、***与农民或合作社签订订单实现规模经营的方式、农业社会化服务组织提供专业的生产服务实现区域规模经营等其他形式的粮食适度规模经营。
不过，对于农业补贴向新型经营主体倾斜，也有一些专家学者提出质疑，认为会损害小农利益。中国社科院农村发展研究所研究员李国祥告诉财新记者，大量补贴落入企业口袋，假合作社套取补贴的情况也非常普遍。他认为，补贴对象仍应瞄准以家庭为单位的农户，并应继续完善专门针对低收入小农户的保障机制。
